Hokkaido

Rishiri-Rebun-Sarobetsu Nemzeti Park
Shiretoko Nemzeti Park
Daisetsuzan Nemzeti Park
Akan Nemzeti Park
Kushiro Shitsugen Nemzeti Park
Shikotsu-Toya Nemzeti Park

Tohoku

Towada-Hachimantai Nemzeti Park
Rikuchu Kaigan Nemzeti Park
Bandai-Asahi Nemzeti Park

Kantō

Nikkō Nemzeti Park
Oze Nemzeti Park
Chichibu Tamakai Nemzeti Park
Joshinetsu Kogen Nemzeti Park
Ogasawara Nemzeti Park
Fuji-Hakone-Izu Nemzeti Park

Chūbu

Chūbu-Sangaku Nemzeti Park
Hakusan Nemzeti Park
Minami Alps Nemzeti Park

Kansai

Ise-Shima Nemzeti Park
Yoshino-Kumano Nemzeti Park

Chūgoku & Shikoku

San-in Coast Nemzeti Park
Daisen-Oki Nemzeti Park
Setonaikai Nemzeti Park
Ashizuri-Uwakai Nemzeti Park

Kyūshū

Saikai Nemzeti Park
Unzen-Amakusa Nemzeti Park
Aso Nemzeti Park
Kirishima-Yaku Nemzeti Park

Okinawa

Iriomote Nemzeti Park